準建證與建設工程規劃許可證的關系

一戶村民于96年取得了一宗國有土地，性質載明為商住，同年取得鄉政府頒發的“準建證”，并辦理了當時的施工許可手續（有證哦，像個大獎狀似的）?，F在是2012年，房屋早就建成并使用多年，可是現在才要辦理房產證。房管局見沒有建設工程規劃許可證不予房產登記，問這個事情如何處理。

我本人一直沒有接觸過農民建房，對這個案例，確實不了解，搜索了“準建證”，發現找不到準確的全稱，也不懂到底這個證應該由哪個部門來發，與建設工程規劃許可證到底是什么關系，如果當時鄉政府發“準建證”代理建設工程規劃許可證，這個建筑應當算是違法建筑了么？還是作為一種實際情況，對越權審批做確認呢？

請大家討論一下?。?！